房屋稅適用稅率依據使用情形而有不同，地方稅務局表示，房屋若存放貨物供作倉庫使用，即使沒有設立營業商號，房屋稅仍應按營業用稅率3%來課徵。
彰化縣地方稅務局表示，一般民眾常誤解，設有營業商號登記的房屋才按營業用稅率課徵房屋稅，但所謂「營業使用」，不以門市交易為限，只要與營業有關，像是辦公室、會議室、展示中心、存放貨物的倉庫等，均屬供營業使用。
稅務局指出，即使房屋並未設立營業商號登記，但堆置與營業有關物品，仍應以營業用稅率課徵房屋稅。目前全台各縣市訂定的營業用房屋稅率皆為3%。
稅務局提醒，房屋使用情形若變更，記得向房屋所在地的稅稽徵機關申報。另外稅務局也提醒，房屋若同時作住家及營業用，可申請依實際使用面積，分別按住家用及營業用稅率課徵房屋稅，不過非住家用課稅面積最低不可少於全部面積六分之一。
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